3.5. 其他文件

其他输出文件是否输出,一般取决于计算类型和参数文件中部分参数的设置。其他文件一般都输出在xx_DATA文件夹当中。 一般的其他输出文件包括并行信息文件、电荷密度文件、波函数文件、+U的占据数文件、能带态密度数据等。

3.5.1. 并行信息文件

并行信息文件parallel_info.json文件是一个JSON文件,里面是和并行相关的信息。

3.5.2. 电荷密度文件

电荷密度文件rho.hdf5是一个hdf5文件,这是一个二进制文件,里面是电荷密度信息。

在计算任务中设置 output_rhotrue,计算完成后就会在输出目录中输出电荷密度文件。

3.5.3. 波函数文件

波函数文件wfc.hdf5是一个二进制文件,里面是波函数信息。

在scf/relax/vc_relax计算任务中设置 wfc_outputtrue,计算完成后就会在输出目录中输出波函数文件。

3.5.4. +U占据数文件

+U占据数文件ns.hdf5是一个hdf5文件,里面是+U占据数信息。

在计算任务中设置 output_nstrue,计算完成后就会在输出目录中输出+U的占据数文件。

3.5.5. 能带数据文件

能带数据文件band.data里面是能带数据。在能带计算任务结束后会输出本文件。

band.data第一行为体系的费米能级,数值直接从输入文件中读取。 从第二行到最后一行则为具体的能带数据,第一列为k点坐标,第二列到最后一列为该k点的能级。

Fermi energy:   1.71363823 eV
  0.00000000        -18.20901967     -6.28726976     -1.65967288     -1.65966902      4.17248420      8.34278377      9.83141556      9.83142060     11.11282658
  0.03901713        -18.19420546     -6.26943990     -1.69281472     -1.72198070      4.19261806      8.36177310      9.83920706      9.89679221     11.13391393
  0.07803425        -18.14977728     -6.21612537     -1.78851132     -1.90314028      4.25302639      8.41861818      9.85908995     10.08991711     11.19669073
  0.11705138        -18.07577135     -6.12740408     -1.94058422     -2.19437237      4.35372258      8.51317766      9.88138639     10.40313881     11.29975618
  0.15606850        -17.97226420     -6.00339671     -2.13880708     -2.58171861      4.49471264      8.64517328      9.89480638     10.82560659     11.44111774

#中间省略

  3.36280883        -18.20901967     -6.28726976     -1.65967288     -1.65966902     11.11282674      8.34278377      9.83142060      4.17248420      9.83141556
  3.36280883        -18.20901967     -6.28726976     -1.65967288     -1.65966902     11.11282658      8.34278377      9.83142060      4.17248420      9.83141556
  3.36280883        -18.20901967     -6.28726976     -1.65967288     -1.65966902     11.11282658      8.34278377      9.83142060      4.17248420      9.83141556

3.5.6. 态密度数据文件

态密度数据文件dos.data和投影态密度数据文件pdos.data,里面是态密度数据。在态密度或投影态密度计算任务结束后会输出本文件。

dos.data文件有3列(非自旋极化计算)或5列(自旋极化计算),以下以非自旋极化计算为例。 第一列为能量,第二列为该能量对应电子态密度,第三列为该能量对应的积分电子态密度。

如果为自旋极化计算,第一列为能量,第二列和第三列分别对应自旋向上和自旋向下的电子态密度,第三列和第五列分别对应自旋向上和自旋向下的积分电子态密度

 -9.90000000          0.00000000      0.00000000
 -9.80000000          0.00000000      0.00000000
 -9.70000000          0.00000000      0.00000000
 -9.60000000          0.00000000      0.00000000
 -9.50000000          0.00000000      0.00000000

#中间省略

  9.70000000         53.64253931     10.68738756
  9.80000000         65.31794752     10.90601663
  9.90000000         83.61396565     11.18918011
 10.00000000         86.69113656     11.50229414

pdos.data文件有9列(非自旋极化计算)或17列(自旋极化计算),以下以非自旋极化计算为例。 第一列为能量,第二列到第九列分别为为该能量的s/px/py/pz/dxy/dyz/dxz/dx2-y2/dz2这八个轨道对应的电子态密度。

如果为自旋极化计算,第一列为能量,第二列到第十七列分别为该能量的s自旋向上/s自旋向下/px自旋向上/px自旋向下/ py自旋向上/py自旋向下/pz自旋向上/pz自旋向下/dxy自旋向上/dxy自旋向下/dyz自旋向上/ dyz自旋向下/dxz自旋向上/dxz自旋向下/dx2-y2自旋向上/dx2-y2自旋向下/dz2自旋向上/dz2自旋向下这些轨道对应的电子态密度。

-7.1  1.0541689858804303e-13  3.459591351158813e-28   1.3247289355553612e-25  2.4772671638045574e-26  1.05417472628338e-13    5.17398976502059e-27    1.6454845415400537e-26  6.864180075587746e-27
-7.0  3.318473099691375e-12   1.0890626634359785e-26  4.170182765670819e-24   7.798317493630582e-25   3.318491170202863e-12   1.62874701146319e-25    5.17990593557267e-25    2.1608107653870136e-25
-6.9  7.973744706576932e-11   2.6168383430653183e-25  1.0020262860144489e-22  1.873807349555619e-23   7.973788127042006e-11   3.913611010502224e-24   1.2446461457885644e-23  5.192072644500735e-24

#中间省略

9.8   0.012014302704341126    0.020481346241337066    0.020481272465114022    0.020481227960165483    0.012014141605124375    0.020481340550052768    0.020481152312365046    0.020481113950946785
9.9   0.015208272205623041    0.021822820790129857    0.021822822323016276    0.021822773322494115    0.015208091498469998    0.02182282957460573     0.02182268094571032     0.021822643831825018
10.0  0.01879792266975167     0.023215197940067867    0.02321516775401225     0.023215121700844416    0.018797722679318573    0.0232151985628671      0.023215019913803658    0.02321498631379775

3.5.7. COHP数据文件

COHP数据文件cohp.data里面是COHP数据。在COHP计算任务结束后会输出本文件。

cohp.data文件的列数与原子数目和自旋有关。 对于非自旋极化计算,第一列为能量,从第二列开始,每一列是一对原子直接的COHP的值。注意原子和自身是没有COHP的,因此总列数是 1 + (n_atoms - 1) * n_atoms / 2。

Energy        Cs1_Cl2
-1.99 1.9883897233767425e-12
-1.98 -8.753291334908602e-25
-1.97 -0.0

#中间省略

17.98 -0.0035456229183618944
17.990000000000002    -0.0035620408832405487
18.0  -0.0035760178257905105

对于自旋极化计算,第一列为能量,从第二列开始,每一列是一对原子的向上或向下自旋直接的COHP的值。注意原子和自身是没有COHP的,因此总列数是 2 + (n_atoms - 1) * n_atoms。

Energy        Si1_Si2_up      Si1_Si2_dn
-6.63 5.660783489404823e-10   5.660786769361608e-10
      -6.62   1.035341621457173e-9    1.035342206900957e-9
      -6.61   1.8732625049870303e-9   1.87326353809432e-9
      -6.6    3.352906524175619e-9    3.3529083265093685e-9

#中间省略

17.51 -0.45697607140995533    -0.45697372422567795
      17.52   -0.4524691839386468     -0.4524676397965906
      17.53   -0.4476843228909244     -0.4476835133040479
      17.54   -0.4426343023138934     -0.4426341569000758
      17.55   -0.43734044424685226    -0.437340891903924

3.5.8. 原子电荷和磁矩文件

原子电荷和磁矩文件ATOMIC里面是原子的电荷和磁矩信息。在输入文件的job模块中的 output_atomic_charge 设置为 true 时会输出本文件。

第一行和第二行为固定的标题。第三行到倒数第三行是具体的数据。每一行包括元素名称、原子编号、原子电荷值、原子绝对磁矩、原子相对磁矩。 最后两行为体系的总磁矩(所有原子的磁矩之和)和绝对磁矩(所有原子的磁矩的绝对值之和)。

Atomic charge and magnetizations:
Element index  charge   magnet   magnet(rela)
O       1      6.4015   0.0000   0.0000
O       2      6.4015   0.0000   0.0000
Fe      3     15.9218   3.9442   0.2465
Fe      4     15.9220  -3.9441  -0.2465
total magnetization     =      -0.00
absolute magnetization  =       7.42